佐助和小智三人现在正一起向着的新岛方向不断前进，之前小智在海边，为石英大会进行最后准备的时候，小智的训练被一只送信的快龙给打断了。
看到那封信到时候，佐助就知道自己等待的精灵出现了，在和小智一起旅行的近一年时间里，佐助可是有了一段惊心动魄的旅行。
先是在枯叶镇的时候，坐上了豪华游轮，佐助也在游轮上将准备好的精灵交换给了小刚和小霞，在经历了沉船事件后，佐助又和巨大的毒刺水母进行了一场对战。
然后佐助先后又经历了不少的事故，比如巴大蝴的集体恋爱事件，会将人变成娃娃的道馆馆主，浅红道馆的忍者训练家，野生原野区的迷你龙事件，大傻谷的古代化石精灵等等的一系列事件。
这些很是刺激的事情，让佐助很是开怀，果然和小智一起旅行十分的有趣，并且佐助也因此收获了不少，首先通过对小智他们神奇宝贝的研究，佐助已经完善了自己关于神奇宝贝进化的最后短板，现在佐助已经晋级为十级饲育家了。
通过对小霞的伊布进化时情况的研究分析，佐助已经清楚的知道了卡蒂狗进化的真正方式，并且佐助现在已经可以确定，等卡蒂狗进化的时候，只要自己以纯粹且数目庞大的火属性灵气进行辅助，自己的风速狗绝对可以展露出传说中神奇宝贝的风采，并且卡蒂狗也可以在体内世界进行培育了。
值得一提的是，佐助和阿桔的战斗情况了，虽然阿桔的神奇宝贝个体值完全比不上佐助，但是通过阿桔的指挥，竟然可以和佐助比拼的有声有色，并且还给佐助带来了不少的灵感，发现原来有时候在战斗的时候还能这么灵活，所以虽然阿桔最终还是被佐助以美纳斯六穿一了，但是佐助对阿桔还是十分欣赏的。
至于大傻谷波克比的蛋，现在它正安稳的被小霞抱在怀里，本来佐助想要波克比蛋的，不过后来他还是放弃了，因为波克基斯对自己来说并没有什么太大的帮助，这样的话还不如让小霞照顾这个孩子。
之后佐助和小智他们又经历了不少的事情，最后都有惊无险的度过了，最后佐助也在小智挑战完常磐道馆，并成功的获得了胜利以后，正式的将宝宝暴龙交给了他。
……
看着不远处的港口，佐助的心底剧烈的波动起来，马上就能和超梦见面了吗？不知道以路卡利欧现在的实力能不能打败超梦。
现在佐助手上的精灵，已经全部达到了满级的状态，并且可能是因为已经和佐助混熟了的缘故，现在小刚对佐助已经没那么敬畏了，虽然他现在对佐助还很尊敬，但已经没有和偶像见面的那种紧张了。
不过要说变化最大的，那当然还要数小霞了，本来想要成为水系神奇宝贝大师的她，小霞见过佐助的美纳斯以后，就缠了佐助很久，因为她想要得到一只美纳斯，可是当佐助告诉她，因为她对神奇宝贝的偏见，可能会对笨笨鱼造成心里创伤并且再也无法进化成美纳斯后，小霞突然改变了不少，因为佐助当时十分的认真，所以小霞明白那并不是拒绝自己的推辞，而是佐助真的是这么看的，这让小霞很不开心，不过反思了一下自己的行为后，小霞不得不承认，现在自己的确不适合照顾美纳斯。
于是小霞就和佐助做了一个约定，当佐助认为小霞已经可以帮助笨笨鱼以后，佐助就要为小霞准备一只笨笨鱼。
之后的情况，就和剧场版的情况基本上没什么区别，不过为了节省时间，佐助便让美纳斯拖着一艘小船，引领着他们向着新岛的位置赶去。
佐助他们顺利的来到了新岛，并且佐助还发现了梦幻的踪迹，不过佐助对梦幻和超梦都没什么想法，只是单纯的想和他们战一场。
在乔伊小姐的引领下，佐助还见到了比他们提前进来的训练家，然后大家就攀谈了起来，不过佐助却在这时看向了头顶，因为从进入新岛的范围后，佐助就一直可以感知到一股无处不在的精神力，刚刚在佐助他们进入城堡后，那股精神力就突兀的变得活跃了起来。
知道主人即将出场，所以佐助便将路卡利欧放了出来，然后佐助便直接看向楼梯的位置，果然超梦从楼梯上缓缓的走了下来，看到佐助身边的路卡利欧时，超梦的瞳孔便不禁一缩，不过出于对自己实力的信心，超梦很快便将目光放到了其他来客的身上。
之后就是复制体和原型之间的战斗了，不过佐助打算和超梦好好的战一场，所以就没有阻止这些人神奇宝贝的失败。
不过当超梦拿出黑暗球，准备用它抢夺其他人的精灵时，佐助就知道自己等待的时机已经到了，所以佐助便直接站了出来，然后对超梦开口道：“超梦，不知道你有没有兴趣和我好好的战一场呢？”
超梦的眉头微皱，然后中二的开口道：“我知道你的实力还不错，既然你这么想死，那就接受我的制裁吧！”
看着托大的超梦，佐助实在是没有了说话的兴趣，于是便直接将右手的食指点在了自己胸口的mega键石，然后在一阵彩光过后，路卡利欧就已经完成了mega进化，实力明显上升了不止一个级别。
看着佐助身前的路卡利欧，超梦的脸色有些难看，它哪里还不明白，现在的路卡利欧可以说是一个非常厉害角色了，自己可能也对付不了它，不过自己怎么可能放弃？
于是接下来的时间，在场的众人就看到了一场痛快无比的神奇宝贝对战。
和超梦比较起来，随着佐助的指挥，路卡利欧的不断的在超梦身上留下伤害，这一年里的时间里，佐助并没有落下对神奇宝贝的锻炼，所以路卡利欧才能在超梦的手里坚持这么久的时间，并且越战越勇的路卡利欧，随着战斗的进行很快便将平日里佐助的教导融会贯通了，现在已经可以和超梦对战，并且不会处于下风了。